据悉，除上述部门外，遭受攻击的还有国民党、新党等网站，“匿名者”并将台湾银行网站列入攻击名单。“行政院”资通安全办公室官员表示，政府内部系统皆未被“骇入”，但攻击行动让政府网页停摆，影响政府对民众服务的“便民性”。
传统黑客是采DoS的方式，在同一时间大量连结网站，以致网站无法负荷而瘫痪，由于是单点发动攻击，很快可被资安人员发现，阻断后网站就可恢复正常。但最新手法是采多点式分散攻击，因资安人员难以分辨孰为正常连结，孰为非正常连结而难以阻断，唯一的方式是保护主机不受攻击，待攻击流量撤退后，马上恢复正常。
官员形容，这好似一家餐厅可能因座位有限，暂时不便招待客人，但却保有正常的出菜能力。
官员为免黑客掌握各单位网站承载量，不便公布各机关3日遭受DDoS攻击的统计。但官员表示，黑客攻击目标都是全球信息网，暂时没有骇入内部网站；但全球信息网多为提供民众查阅资料，网站无法对民众服务，造成民众不便，呼吁各界应循理性管道沟通课纲争议，而不是瘫痪网站，波及无辜。
黑客撒下天罗地网发动攻击，台当局也启动全面防备。有鉴于资安问题愈来愈险峻，为妥善因应，“行政院”今年6月4日已核定新版的信息安全规范，全面升级资安控管，包括马英九办公室、“五院”及所属二级单位，还有涉及外事、防务、经济等单位全都纳入A级控管；而A级、B级纳管共近700个单位，较过去倍增。
而原本分为A、B、C、D四级的资安分层管理，也直接删除最弱的D级，最终包括政府机关、公营事业、学术机关等共7287个单位皆纳管分级；过去只有300多个单位纳入A级、B级，今年已倍增到696个单位。
事实上，为免黑客入侵政府网站，窃取机密数据，各部会都有严格的网站管理。而从外网连结内网，也有严密的防火墙，只要是来自“黑名单”的联机，一定阻挡。